Une fois le chargement livré, la facture est générée automatiquement dans 3PL Dynamics TMS ou les informations sont conservées pour une facture groupée. Le service administratif peut contrôler les informations de livraisons et envoyer la facture. Des coûts supplémentaires comme les heures d'attente, le reconditionnement ou les frais de réservation, peuvent être ajoutées sur la facture.
Si le transport est externalisé, la facture du sous-traitant peut être contrôlée grâce au lien entre la commande de transport et les accords tarifaires. La facturation automatique d’achat est également possible. La facture d'achat sera jointe au fichier par "scanning de documents".